- Код статьи
- S30345057S2686738925020098-1
- DOI
- 10.7868/S3034505725020098
- Тип публикации
- Статья
- Статус публикации
- Опубликовано
- Авторы
- Том/ Выпуск
- Том 521 / Номер выпуска 1
- Страницы
- 219-224
- Аннотация
- Альтернативный сплайсинг представляет собой важный механизм, обеспечивающий генетическое разнообразие белков. У Drosophila melanogaster были обнаружены уникальные локусы, где разнообразие мРНК возникает в результате транс-сплайсинга - процесса, при котором экзоны из различных пре-мРНК соединяются. Наиболее подробно исследован транс-сплайсинг в локусе mod(mdg4), который кодирует более 31 изоформы. Важными элементами для этого процесса являются ранее описанные консервативные последовательности в четвертом интроне. Целью данного исследования является дальнейшая характеристика консервативных мотивов четвертого интрона, а именно элемента на 5'-конце интрона. С помощью модельных трансгенных линий показано, что внесенные замены в последовательность изучаемого элемента приводят к нарушению транс-сплайсинга. Напротив, аналогичные изменения в эндогенном локусе не привели к нарушению транс-сплайсинга. Таким образом, консервативный элемент играет роль в транс-сплайсинге, но не является ключевым.
- Ключевые слова
- альтернативный сплайсинг транс-сплайсинг Drosophila melanogaster mod(mdg4) сайты сплайсинга
- Дата публикации
- 15.04.2025
- Год выхода
- 2025
- Всего подписок
- 0
- Всего просмотров
- 39
Библиография
- 1. Wright C.J., Smith C.W.J., Jiggins C.D. Alternative splicing as a source of phenotypic diversity. // Nat Rev Genet, 2022, № 23(11): P. 697-710.
- 2. Labrador M., Mongelard F., Plata-Rengifo P., et al. Protein encoding by both DNA strands. // Nature, 2001, № 409(6823): P. 1000.
- 3. Horiuchi T., Giniger E., Aigaki T. Alternative trans-splicing of constant and variable exons of a Drosophila axon guidance gene, lola. // Genes Dev, 2003, № 17(20): P. 2496-501.
- 4. Shi X., Singh S., Lin E., et al. Chimeric RNAs in cancer. // Adv Clin Chem, 2021, № 100: P. 1-35.
- 5. Tikhonov M., Utkina M., Maksimenko O., et al. Conserved sequences in the Drosophila mod(mdg4) intron promote poly(A)-independent transcription termination and trans-splicing. // Nucleic Acids Res, 2018, № 46(20): P. 10608-10618.
- 6. Gao J.L., Fan Y.J., Wang X.Y., et al. A conserved intronic U1 snRNP-binding sequence promotes trans-splicing in Drosophila. // Genes Dev, 2015, № 29(7): P. 760-71.
- 7. McManus C.J., Duff M.O., Eipper-Mains J., et al. Global analysis of trans-splicing in Drosophila. // Proc Natl Acad Sci USA, 2010, № 107(29): P. 12975-9.
- 8. Bonchuk A.N., Balagurov K.I., Baradaran R., et al. The Arthropoda-specific Tramtrack group BTB protein domains use previously unknown interface to form hexamers. // Elife, 2024, № 13.
- 9. Melnikova L., Kostyuchenko M., Molodina V., et al. Multiple interactions are involved in a highly specific association of the Mod(mdg4)-67.2 isoform with the Su(Hw) sites in Drosophila. // Open Biol, 2017, № 7(10).
- 10. Soldatova Iu., Shepelev M., Georgiev P., et al. A Novel Mechanism for Transcription Termination in the mod(mdg4) Locus of Drosophila melanogaster. // Biology (Basel), 2024 in press.
- 11. Kaida D., Berg M.G., Younis I., et al. U1 snRNP protects pre-mRNAs from premature cleavage and polyadenylation. // Nature, 2010, № 468(7324): P. 664-8.
- 12. Tikhonov M., Georgiev P., Maksimenko O.Competition within Introns: Splicing Wins over Polyadenylation via a General Mechanism. // Acta Naturae, 2013, № 5(4): P. 52-61.
- 13. Bischof J., Maeda R.K., Hediger M., et al. An optimized transgenesis system for Drosophila using germ-line-specific phiC31 integrases. // Proc Natl Acad Sci U S A, 2007, № 104(9): P. 3312-7.
- 14. Hernandez G., Vazquez-Pianzola P., Sierra J.M., et al.Internal ribosome entry site drives cap-independent translation of reaper and heat shock protein 70 mRNAs in Drosophila embryos. // RNA, 2004, № 10(11): P. 1783--97.
- 15. Zhang X., Koolhaas W.H., Schnorrer F. A versatile two-step CRISPR- and RMCE-based strategy for efficient genome engineering in Drosophila. // G3 (Bethesda), 2014, № 4(12): P. 2409-18.
- 16. Ozturk-Colak A., Marygold S.J., Antonazzo G., et al. FlyBase: updates to the Drosophila genes and genomes database. // Genetics, 2024, № 227(1).
- 17. Crooks G.E., Hon G., Chandonia J.M., et al. WebLogo: a sequence logo generator. // Genome Res, 2004, № 14(6): P. 1188-90.
