Президиум РАНДоклады Российской академии наук. Науки о жизни Doklady Biological Sciences

  • ISSN (Print) 2686-7389
  • ISSN (Online) 3034-5057

Исследование консервативности последовательностей, определяющих транс-сплайсинг в локусе mod(mdg4) у видов дрозофилы и шелкопряда

Код статьи
S2686738925010212-1
DOI
10.31857/S2686738925010212
Тип публикации
Статья
Статус публикации
Опубликовано
Авторы
Том/ Выпуск
Том 520 / Номер выпуска 1
Страницы
128-132
Аннотация
Сплайсинг, являясь ключевым этапом созревания мРНК, играет важную роль в регуляции экспрессии генов эукариот. Образование химерных мРНК из двух транскриптов при сплайсинге является запрещенным процессом, однако у насекомых для нескольких локусов транс-сплайсинг является основным способом увеличения белкового разнообразия. Целью работы является исследование эволюционной консервативности последовательностей, ответственных за транс-сплайсинг в локусе mod(mdg4), у видов из семейства Drosophilidae отряда двукрылые и шелкопряда (Bombyx mori), который относится к отряду чешуикрылых. С помощью модельных трансгенных линий показано, что последовательности удаленных видов дрозофилы сохраняют способность поддерживать транс-сплайсинг у D. melanogaster. Напротив, аналогичные последовательности шелкопряда не поддерживают транс-сплайсинг. Таким образом, РНК-мотивы и связывающие их гипотетические белковые факторы, определяющие транс-сплайсинг, остаются консервативными среди группы Drosophilidae, но функционально разошлись у двукрылых и чешуекрылых.
Ключевые слова
альтернативный сплайсинг транс-сплайсинг Drosophila melanogaster Bombyx mori
Дата публикации
15.09.2025
Год выхода
2025
Всего подписок
0
Всего просмотров
16

Библиография

  1. 1. Gehring, N.H. and J.Y. Roignant. Anything but Ordinary – Emerging Splicing Mechanisms in Eukaryotic Gene Regulation // Trends Genet. 2021. 37(4). Р. 355-372.
  2. 2. McManus, C.J., et al. Global analysis of trans-splicing in Drosophila // Proc Natl Acad Sci U S A. 2010. 107(29). Р. 12975-9.
  3. 3. Baralle, F.E. and J. Giudice. Alternative splicing as a regulator of development and tissue identity // Nat Rev Mol Cell Biol. 2017. 18(7). Р. 437-451.
  4. 4. Shenasa, H. and D.L. Bentley. Pre-mRNA splicing and its cotranscriptional connections // Trends Genet. 2023. 39(9). Р. 672–685.
  5. 5. Büchner, K., et al. Genetic and molecular complexity оf the position effect variegation modifier mod(mdg4) in Drosophila // Genetics. 2000. 155(1). Р. 141–57.
  6. 6. Dorn, R., G. Reuter, and A. Loewendorf, Transgene analysis proves mRNA trans-splicing at the complex mod(mdg4) locus in Drosophila // Proc Natl Acad Sci U S A. 2001. 98(17). Р. 9724–9.
  7. 7. Horiuchi, T., E. Giniger, and T. Aigaki. Alternative trans-splicing of constant and variable exons of a Drosophila axon guidance gene, lola // Genes Dev. 2003. 17(20). Р. 2496–501.
  8. 8. Lei, Q., et al. Evolutionary Insights into RNA trans- Splicing in Vertebrates // Genome Biol Evol. 2016. 8(3). Р. 562–77.
  9. 9. Kong, Y., et al. The evolutionary landscape of intergenic trans-splicing events in insects // Nat Commun. 2015. 6. Р. 8734.
  10. 10. Gao, J.L., et al. A conserved intronic U1 snRNPbinding sequence promotes trans-splicing in Drosophila // Genes Dev. 2015. 29(7). Р. 760–71.
  11. 11. Tikhonov, M., et al. Conserved sequences in the Drosophila mod(mdg4) intron promote poly(A)-independent transcription termination and trans-splicing // Nucleic Acids Res. 2018.
  12. 12. Krauss, V. and R. Dorn. Evolution of the trans-splicing Drosophila locus mod(mdg4) in several species of Diptera and Lepidoptera // Gene. 2004. 331. Р. 165–76.
  13. 13. Labrador, M. and V.G. Corces. Extensive exon reshuffling over evolutionary time coupled to trans-splicing in Drosophila // Genome Res. 2003. 13(10). Р. 2220–8.
  14. 14. Shao, W., et al. Alternative splicing and trans-splicing events revealed by analysis of the Bombyx mori transcriptome // RNA. 2012. 18(7). Р. 1395–407.
  15. 15. Tong, K.J., et al. INSECT PHYLOGENOMICS. Comment on “Phylogenomics resolves the timing and pattern of insect evolution” // Science. 2015. 349(6247). Р. 487.
  16. 16. Misof, B., et al. Phylogenomics resolves the timing and pattern of insect evolution // Science. 2014. 346(6210). Р. 763–7.
  17. 17. Hernández, G., et al. Internal ribosome entry site drives cap-independent translation of reaper and heat shock protein 70 mRNAs in Drosophila embryos // RNA. 2004. 10(11). Р. 1783–97.
  18. 18. Bischof, J., et al. An optimized transgenesis system for Drosophila using germ-line-specific phiC31 integrases // Proc Natl Acad Sci USA. 2007. 104(9). Р. 3312–7.
QR
Перевести

Индексирование

Scopus

Scopus

Scopus

Crossref

Scopus

Высшая аттестационная комиссия

При Министерстве образования и науки Российской Федерации

Scopus

Научная электронная библиотека