Президиум РАНДоклады Российской академии наук. Науки о жизни Doklady Biological Sciences

  • ISSN (Print) 2686-7389
  • ISSN (Online) 3034-5057

Транскриптомные сдвиги в мультипотентных мезенхимальных стромальных клетках при моделировании эффектов микрогравитации

Код статьи
S2686738925010159-1
DOI
10.31857/S2686738925010159
Тип публикации
Статья
Статус публикации
Опубликовано
Авторы
Том/ Выпуск
Том 520 / Номер выпуска 1
Страницы
95-99
Аннотация
Одним из наиболее явных проявлений негативного воздействия факторов космического полета на организм космонавтов является остеопения. С активным развитием пилотируемых космических полетов и увеличением продолжительности пребывания космонавтов в условиях невесомости растет необходимость понимания механизмов изменений, происходящих на уровне мультипотентных мезенхимальных стромальных клеток, участвующих в ремоделировании костной ткани. С помощью метода РНК-секвенирования изучали изменения транскриптомного профиля ММСК после 5-суточного моделирования эффектов микрогравитации. Обнаружено выраженное снижение экспрессии группы генов, продукты которых задействованы в процессах, связанных с пролиферацией клеток, в частности, в митотической фазе клеточного цикла. Сдвиги транскрипционного профиля ММСК были подтверждены подсчетом веретен деления и анализом их структуры с помощью флуоресцентной микроскопии. Полученные результаты указывают на снижение пролиферативной активности культивируемых ММСК в условиях моделирования эффектов микрогравитации в течение 5-ти суток.
Ключевые слова
мультипотентные мезенхимальные стромальные клетки (ММСК) пролиферация моделированная микрогравитация экспрессия генов РНК-секвенирование
Дата публикации
16.09.2025
Год выхода
2025
Всего подписок
0
Всего просмотров
18

Библиография

  1. 1. Буравкова Л.Б. Механизмы клеточной гравичувствительности. М.: ГНЦ РФ – ИМБП РАН; 2018.
  2. 2. Gershovich P., Gershovich J., Zhambalova A., et al. Cytoskeletal proteins and stem cell markers gene expression in human bone marrow mesenchymal stromal cells after different periods of simulated microgravity // Acta Astronautica. 2012. Vol. 70, P. 36–42.
  3. 3. Andrews, S. (n.d.). FastQC A Quality Control tool for High Throughput Sequence Data. Доступно по: http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/ Ссылка активна на 25 сентября 2024.
  4. 4. Krueger, F. (2021). Trim Galore. Доступно по: https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/trim_galore/ Ссылка активна на 25 сентября 2024.
  5. 5. Kim, D., Langmead, B., Salzberg, S. L. HISAT: a fast spliced aligner with low memory requirements // Nature Methods. 2015. Т. 12 №4, 357–360.
  6. 6. Liao, Y., Smyth, G. K., Shi, W. featureCounts: an efficient general purpose program for assigning sequence reads to genomic features // Bioinformatics. 2013. Т. 30. № 7. 923–930.
  7. 7. Love, M. I., Huber, W., & Anders, S. Moderated estimation of fold change and dispersion for RNA-seq data with DESeq2 // Genome Biology. 2014. T. 15. № 12.
  8. 8. Szklarczyk, D., Kirsch, R., Koutrouli, M., et al. The STRING database in 2023: protein-protein association networks and functional enrichment analyses for any sequenced genome of interest // Nucleic acids research. 2023. T. 51, №D1, C. 638–D646.
  9. 9. Gene Ontology Consortium. The Gene Ontology resource: enriching a GOld mine // Nucleic Acids Res. 2021. Т. 49, №D1. С. 325-D334.
  10. 10. Li X., Huang W., Huang W., et al. Kinesin family members KIF2C/4A/10/11/14/18B/20A/23 predict poor prognosis and promote cell proliferation in hepatocellular carcinoma // Am J Transl Res. 2020. Т. 12, №5. С. 1614-1639.
  11. 11. Li L., Zhang C., Chen J.L., et al. Effects of simulated microgravity on the expression profiles of RNA during osteogenic differentiation of human bone marrow mesenchymal stem cells // Cell Prolif. 2019. Т. 52, №2. С. 12539.
  12. 12. Wei L., Diao Y., Qi J., et al. Effect of change in spindle structure on proliferation inhibition of osteosarcoma cells and osteoblast under simulated microgravity during incubation in rotating bioreactor // PLoS One. 2013. Т. 8, №10. С. 76710
  13. 13. Tran M.T., Ho C.N.Q., Hoang S.N., et al. Morphological Changes of 3T3 Cells under Simulated Microgravity // Cells. 2024. Т. 13, № 4. С. 344.
  14. 14. Ratushnyy, A.Y., & Buravkova, L.B. Microgravity Effects and Aging Physiology: Similar Changes or Common Mechanisms? // Biochemistry. Biokhimiia. 2023. Т. 88. №11. С. 1763–1777.
  15. 15. Touchstone, H., Bryd, R., Loisate, S., et al. Recovery of stem cell proliferation by low intensity vibration under simulated microgravity requires LINC complex //NPJ microgravity. 2019.Т. 5, № 11.
  16. 16. Sokolovskaya, A.A., Sergeeva, E.A., Metelkin, et al. The Expression of Cell Cycle Cyclins in a Human Megakaryoblast Cell Line Exposed to Simulated Microgravity // International journal of molecular sciences. 2024. Т. 25. №12. С. 6484.
  17. 17. Yuge, L., Kajiume, T., Tahara, H., et al. Microgravity potentiates stem cell proliferation whilesustaining the capability of differentiation // Stem CellsDev. 2006. Т. 15, С. 921–929.
  18. 18. Ho, C.N.Q., Hoang, S.N., Nguyen, H.H., et al. The adaptation of 3T3 cells to simulated microgravity by retrieving the major cell cycle-related protein expression during long-term in vitro proliferation // Tissue & cell. 2024. Т. 89. C. 102460.
  19. 19. Sokolovskaya A., Ignashkova T., Bochenkova A., et al. Effects of simulated microgravity on cell cycle in human endothelial cells // Acta Astronautica. 2014. Т. 99. С. 16–23.
  20. 20. Markina E., Tyrina E., Ratushnyy A., et al. Heterotypic Cell Culture from Mouse Bone Marrow under Simulated Microgravity: Lessons for Stromal Lineage Functions // International Journal of Molecular Sciences. 2023. T. 24. №18, 13746.
QR
Перевести

Индексирование

Scopus

Scopus

Scopus

Crossref

Scopus

Высшая аттестационная комиссия

При Министерстве образования и науки Российской Федерации

Scopus

Научная электронная библиотека