- Код статьи
- S30345057S2686738925020125-1
- DOI
- 10.7868/S3034505725020125
- Тип публикации
- Статья
- Статус публикации
- Опубликовано
- Авторы
- Том/ Выпуск
- Том 521 / Номер выпуска 1
- Страницы
- 235-239
- Аннотация
- Автономное функционирование регуляторных доменов в комплексе Bithorax (BX-C) Drosophila mela-nogaster обеспечивается границами (инсуляторами), которые предотвращают взаимодействия между энхансерами и промоторами. Сайленсеры (Polycomb response elements) поддерживают эпигенетическую память в пределах регуляторных доменов и часто расположены рядом с инсуляторами, усиливая их инсуляторную активность. bxd PRE - это хорошо известный сайленсер, который регулирует активность домена bxd/pbx гена Ubx (один из генов BX-C) в первом абдоминальном сегменте. Для исследования инсуляторной активности bxd PRE мы применили стратегию замены границы. В результате было показано, что при интеграции на место границы Fab-7, разделяющей регуляторные домены гена Abd-B в локусе BX-C, bxd PRE обладает слабой инсуляторной активностью.
- Ключевые слова
- роматиновые инсуляторы поликомб PRE bxd/pbx домен GAF Pho
- Дата публикации
- 15.04.2025
- Год выхода
- 2025
- Всего подписок
- 0
- Всего просмотров
- 43
Библиография
- 1. Kyrchanova O., Sokolov V., Georgiev P. Mechanisms of Interaction between Enhancers and Promoters in Three Drosophila Model Systems // International journal of molecular sciences. 2023. 24(3).
- 2. Batut P.J., Bing X.Y., Sisco Z., et al. Genome organization controls transcriptional dynamics during development // Science (New York, NY). 2022. Vol. 375, N6580. P. 566-70.
- 3. Bender W., Akam M., Karch F., Beachy P.A., Peifer M., Spierer P., et al. Molecular Genetics of the Bithorax Complex in Drosophila melanogaster // Science (New York, NY). 1983. Vol. 221, N4605. P. 23-9.
- 4. Maeda R.K., Karch F. The open for business model of the bithorax complex in Drosophila // Chromosoma. 2015. Vol. 124, N3. P.293-307.
- 5. Kuroda M.I., Kang H., De S., Kassis J.A. Dynamic Competition of Polycomb and Trithorax in Transcriptional Programming // Annual review of biochemistry. 2020. Vol. 89. P. 235-53.
- 6. Postika N., Schedl P., Georgiev P., Kyrchanova O. Mapping of functional elements of the Fab-6 boundary involved in the regulation of the Abd-B hox gene in Drosophila melanogaster // Scientific reports. 2021. Vol. 11, N1. P. 4156.
- 7. Kyrchanova O., Kurbidaeva A., Sabirov M., Postika N., Wolle D., Aoki T., et al. The bithorax complex iab-7 Polycomb response element has a novel role in the functioning of the Fab-7 chromatin boundary // PLoS genetics. 2018. Vol. 14, N8. e1007442.
- 8. Brown J.L., Zhang L., Rocha P.P., Kassis J.A., SunM.A. Polycomb protein binding and looping in the ON transcriptional state // Science advances. 2024. Vol. 10, N17.eadn1837.
- 9. Tillib S., Petruk S., Sedkov Y., Kuzin A., Fujioka M., Goto T., et al. Trithorax- and Polycomb-group response elements within an Ultrabithorax transcription maintenance unit consist of closely situated but separable sequences // Molecular and cellular biology. 1999. Vol. 19, N7. P.5189-202.
- 10. Dellino G.I., Tatout C., Pirrotta V. Extensive conservation of sequences and chromatin structures in the bxd polycomb response element among Drosophilid species // The International journal of developmental biology. 2002. Vol. 46, N1. P. 133-41.
- 11. Wolle D., Cleard F., Aoki T., Deshpande G., Schedl P., Karch F. Functional Requirements for Fab-7 Boundary Activity in the Bithorax Complex // Molecular and cellular biology. 2015. Vol. 35, N21. P. 3739-52.
- 12. Mihaly J., Hogga I., Gausz J., Gyurkovics H., Karch F. In situ dissection of the Fab-7 region of the bithorax complex into a chromatin domain boundary and a Polycomb-response element // Development (Cambridge, England). 1997. Vol. 124, N9. P. 1809-20.
- 13. Kyrchanova O., Sabirov M., Mogila V., Kurbidaeva A., Postika N., Maksimenko O., et al.Complete reconstitution of bypass and blocking functions in a minimal artificial Fab-7 insulator from Drosophila bithorax complex // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2019. Vol. 116, N.27. P. 13462-7.
- 14. Mohd-Sarip A., Venturini F., Chalkley G.E., Verrijzer C.P. Pleiohomeotic can link polycomb to DNA and mediate transcriptional repression // Molecular and cellular biology. 2002. Vol. 22, N21. P. 7473-83.
- 15. Fritsch C., Brown J.L., Kassis J.A., Müller J. The DNA-binding polycomb group protein pleiohomeotic mediates silencing of a Drosophila homeotic gene // Development (Cambridge, England). 1999. Vol. 126, N17. P. 3905-13.
- 16. Majumder P., Roy S., Belozerov V.E., Bosu D., Puppali M., Cai H.N. Diverse transcription influences can be insulated by the Drosophila SF1 chromatin boundary // Nucleic acids research. 2009. Vol. 37, N13. P. 4227-33.
- 17. Hagstrom K., Muller M., Schedl P. Fab-7 functions as a chromatin domain boundary to ensure proper segment specification by the Drosophila bithorax complex // Genes & development. 1996. Vo. 10, N24. P. 3202-15.
- 18. Ray P., De S., Mitra A., Bezstarosti K., Demmers J.A., Pfeifer K., et al.Combgap contributes to recruitment of Polycomb group proteins in Drosophila // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2016. Vol. 113, N14. P. 3826-31.
- 19. Erokhin M., Brown J.L., Lomaev D., Vorobyeva N.E., 20. Ohtsuki S., Levine M. GAGA mediates the enhancer Zhang L., Fab L.V., et al. Crol contributes to PREmediated repression and Polycomb group proteins recruitment in Drosophila // Nucleic acids research. 2023. Vol. 51, N12. P. 6087-100. blocking activity of the eve promoter in the Drosophila embryo // Genes & development. 1998. Vol. 12, N21. P. 3325-30.
