Президиум РАНДоклады Российской академии наук. Науки о жизни Doklady Biological Sciences

  • ISSN (Print) 2686-7389
  • ISSN (Online) 3034-5057

ИДЕНТИФИКАЦИЯ ВЫСОКО КОНСЕРВАТИВНОГО РАЙОНА КРИТИЧНОГО ДЛЯ ФУНКЦИОНАЛЬНОСТИ БЕЛКА CP190 У DROSOPHILA MELANOGASTER

Код статьи
S30345057S2686738925020115-1
DOI
10.7868/S3034505725020115
Тип публикации
Статья
Статус публикации
Опубликовано
Авторы
Том/ Выпуск
Том 521 / Номер выпуска 1
Страницы
229-234
Аннотация
Белок СP190 связывается как с промоторами генов домашнего хозяйства, так и с инсуляторными/ граничными элементами и играет критическую роль в их активности. Целью работы являлось изучение влияния делеций в высоко консервативных районах белка CP190 на его функциональность. Показано, что делеция последовательности от 664 до 700 а.о. приводит к летальному фенотипу. Таким образом, в составе СР190 выявлен новый район, играющий важную роль во взаимодействии белка СР190 с еще не идентифицированными белками-партнерами, стабилизации формируемых СP190 белковых комплексов и рекрутировании их на хроматин.
Ключевые слова
CP190 белок-белковые взаимодействия архитектурные C2H2 белки промотор инсулятор регуляция транскрипции
Дата публикации
15.04.2025
Год выхода
2025
Всего подписок
0
Всего просмотров
39

Библиография

  1. 1. Uyehara C.M., Apostolou E. 3D enhancer-promoter interactions and multi-connected hubs: Organizational principles and functional roles // Cell Rep. 2023. P. 112068.
  2. 2. Karpinska M.A., Oudelaar A.M. The role of loop extrusion in enhancer-mediated gene activation // Curr Opin Genet Dev. 2023. V. 79. P. 102022.
  3. 3. Serebreni L., Stark A. Insights into gene regulation: From regulatory genomic elements to DNA-protein and protein-protein interactions // Curr Opin Cell Biol. 2021. V. 70. P. 58-66.
  4. 4. Vo Ngoc L., Kassavetis G.A., Kadonaga J.T. The RNA Polymerase II Core Promoter in Drosophila // Genetics. 2019. V. 212. № 1. P. 13-24.
  5. 5. Kyrchanova O.V., Bylino O.V., Georgiev P.G. Mechanisms of enhancer-promoter communication and chromosomal architecture in mammals and Drosophila // Front Genet. 2022. V. 13. P. 1081088.
  6. 6. Maharjan M., McKowen J.K., Hart C.M. Overlapping but Distinct Sequences Play Roles in the Insulator and Promoter Activities of the Drosophila BEAF-Dependent scs’ Insulator // Genetics. 2020. V. 215. № 4. P. 1003-1012.
  7. 7. Bartkuhn M., Straub T., Herold M., et al. Active promoters and insulators are marked by the centrosomal protein 190 // EMBO J. 2009. V. 28. № 7. P. 877-88.
  8. 8. Plevock K.M., Galletta B.J., Slep K.C., et al. Newly Characterized Region of CP190 Associates with Microtubules and Mediates Proper Spindle Morphology in Drosophila Stem Cells // PLoS One. 2015. V. 10. № 12. P. e0144174.
  9. 9. Oliver D., Sheehan B., South H., et al. The chromosomal association/dissociation of the chromatin insulator protein Cp190 of Drosophila melanogaster is mediated by the BTB/POZ domain and two acidic regions // BMC cell biology. 2010. V. 11. P. 101.
  10. 10. Bonchuk A., Balagurov K., Georgiev P. A structural view of evolution, multimerization, and proteinprotein interactions // Bioessays. 2023. V. 45. № 2. P. e2200179.
  11. 11. Sabirov M., Kyrchanova O., Pokholkova G.V., et al. Mechanism and functional role of the interaction between CP190 and the architectural protein Pita in Drosophila melanogaster // Epigenetics Chromatin. 2021. V. 14. № 1. P. 16.
  12. 12. Kyrchanova O., Klimenko N., Postika N., et al. Drosophila architectural protein CTCF is not essential for fly survival and is able to function independently of CP190 // Biochim Biophys Acta Gene Regul Mech. 2021. V. 1864. № 10. P. 194733.
  13. 13. Melnikova L., Kostyuchenko M., Molodina V., et al. Interactions between BTB domain of CP190 and two adjacent regions in Su(Hw) are required for the insulator complex formation // Chromosoma. 2018. V. 127. № 1. P. 59-71.
  14. 14. Golovnin A., Melnikova L., Babosha V., et al. The N-Terminal Part of Drosophila CP190 Is a Platform for Interaction with Multiple Architectural Proteins // Int J Mol Sci. 2023. V. 24. № 21. P. 15917.
  15. 15. Bag I., Chen S., Rosin L.F., et al. M1BP cooperates with CP190 to activate transcription at TAD borders and promote chromatin insulator activity // Nat Commun. 2021. V. 12. № 1. P. 4170.
  16. 16. Bohla D., Herold M., Panzer I., et al. A functional insulator screen identifies NURF and dREAM components to be required for enhancer-blocking // PLoS One. 2014. V. 9. № 9. P. e107765.
  17. 17. Kwon S.Y., Grisan V., Jang B., et al. Genome-Wide Mapping Targets of the Metazoan Chromatin Remodeling Factor NURF Reveals Nucleosome Remodeling at Enhancers, Core Promoters and Gene Insulators // PLoS Genet. 2016. V. 12. № 4. P. e1005969.
  18. 18. Ali T., Krüger M., Bhuju S., et al. Chromatin binding of Gcn5 in Drosophila is largely mediated by CP190 // Nucleic Acids Res. 2017. V. 45. № 5. P. 2384-2395.
  19. 19. Chen S., Rosin L.F., Pegoraro G., et al. NURF301 contributes to gypsy chromatin insulator-mediated nuclear organization // Nucleic Acids Res. 2022. V. 50. № 14. P. 7906-7924.
  20. 20. Butcher R.D., Chodagam S., Basto R., et al. The Drosophila centrosome-associated protein CP190 is essential for viability but not for cell division // Journal of cell science. 2004. V. 117. № Pt 7. P. 1191-9.
QR
Перевести

Индексирование

Scopus

Scopus

Scopus

Crossref

Scopus

Высшая аттестационная комиссия

При Министерстве образования и науки Российской Федерации

Scopus

Научная электронная библиотека