- Код статьи
- S2686738925010276-1
- DOI
- 10.31857/S2686738925010276
- Тип публикации
- Статья
- Статус публикации
- Опубликовано
- Авторы
- Том/ Выпуск
- Том 520 / Номер выпуска 1
- Страницы
- 164-168
- Аннотация
- Субъединица Bap170 ремоделера хроматина SWI/SNF демонстрирует функции активатора при ее искусственном привлечении на промотор репортера LacZ в энхансер-зависимой транскрипции. В данной работе проведен анализ функциональной значимости доменов белка Bap170 в активации репортера. Делеция ДНК-связывающего домена ARID не снижает активности Bap170. При привлечении формы Bap170 без области, включающей мотивы LXXLL, наблюдалось повышение экспрессии репортера LacZ. Делеции центральной (домен RFX и IDRs) и С-концевой области (цинковые пальцы) Bap170 приводят к существенному снижению экспрессии трансгена. По-видимому, данные области критически важны для функционирования этого белка в энхансер-зависимой транскрипции.
- Ключевые слова
- комплексы SWI/SNF PBAP Bap170 домен ARID энхансер LexA
- Дата публикации
- 15.09.2025
- Год выхода
- 2025
- Всего подписок
- 0
- Всего просмотров
- 19
Библиография
- 1. Reyes, A.A., R.D. Marcum, and Y. He. Structure and Function of Chromatin Remodelers // J Mol Biol. 2021. 433(14). Р. 166929.
- 2. Singh, A., et al. SWI/SNF Chromatin Remodelers: Structural, Functional and Mechanistic Implications // Cell Biochem Biophys. 2023. 81(2). Р. 167–187.
- 3. Hernández-García, J., et al. Comprehensive identification of SWI/SNF complex subunits underpins deep eukaryotic ancestry and reveals new plant components // Communications Biology. 2022. 5(1). Р. 549.
- 4. Chmykhalo, V.K., et al. SWI/SNF Complex Connects Signaling and Epigenetic State in Cells of Nervous System // Mol Neurobiol. 2024.
- 5. Chmykhalo, V.K., et al. Effects of Overexpression of Specific Subunits SAYP, Bap170 of the Chromatin Remodeling Complex in Drosophila Melanogaster // Doklady Biochemistry and Biophysics. 2024.
- 6. Vorobyeva, N.E., et al. SAYP and Brahma are important for ‘repressive’ and ‘transient’ Pol II pausing // Nucleic Acids Res. 2012. 40(15). Р. 7319–31.
- 7. Moshkin, Y.M., et al. Remodelers Organize Cellular Chromatin by Counteracting Intrinsic Histone-DNA Sequence Preferences in a Class-Specific Manner // Molecular and Cellular Biology. 2012. 32(3). Р. 675–688.
- 8. Vorobyeva, N.E., et al. Transcription coactivator SAYP combines chromatin remodeler Brahma and transcription initiation factor TFIID into a single supercomplex // Proc Natl Acad Sci U S A. 2009. 106(27). Р. 11049–54.
- 9. Panov, V.V., et al. Transcription co-activator SAYP mediates the action of STAT activator // Nucleic Acids Res. 2012. 40(6). Р. 2445–53.
- 10. Carrera, I., J. Zavadil, and J.E. Treisman. Two subunits specific to the PBAP chromatin remodeling complex have distinct and redundant functions during drosophila development // Mol Cell Biol. 2008. 28(17). Р. 5238–50.
- 11. Rendina, R., et al. Bap170, a subunit of the Drosophila PBAP chromatin remodeling complex, negatively regulates the EGFR signaling // Genetics. 2010. 186(1). Р. 167–81.
- 12. Carcamo, S., et al. Altered BAF occupancy and transcription factor dynamics in PBAF-deficient melanoma // Cell Reports. 2022. 39(1). Р. 110637.
- 13. Soshnikova, N.V., et al. A novel chromatin-remodeling complex variant, dcPBAF, is involved in maintaining transcription in differentiated neurons // Front Cell Dev Biol. 2023. 11. Р. 1271598.
- 14. Li, M., et al. Inactivating mutations of the chromatin remodeling gene ARID2 in hepatocellular carcinoma // Nat Genet. 2011. 43(9). Р. 828–9.
- 15. Akinjiyan, F.A., et al. ARID2 mutations may relay a distinct subset of cutaneous melanoma patients with different outcomes // Sci Rep. 2024. 14(1). Р. 3444.
- 16. Shidlovskii, Y.V., et al. Subunits of the PBAP Chromatin Remodeler Are Capable of Mediating Enhancer-Driven Transcription in Drosophila // Int J Mol Sci. 2021. 22(6).
- 17. Plevin, M.J., M.M. Mills, and M. Ikura. The LxxLL motif: a multifunctional binding sequence in transcriptional regulation // Trends Biochem Sci. 2005. 30(2). Р. 66–9.
- 18. Bramswig, N.C., et al. Heterozygosity for ARID2 lossof- function mutations in individuals with a Coffin-Siris syndrome-like phenotype // Hum Genet. 2017. 136(3). Р. 297–305.
