By this author

INVESTIGATION OF THE FUNCTIONAL ROLE OF THE CONSERVED SEQUENCE AT THE 5’-END OF THE FOURTH INTRON OF THE MOD(MDG4) GENE IN TRANS- SPLICING IN DROSOPHILA MELANOGASTER

Issue number 1 from 15.04.2025

Альтернативный сплайсинг представляет собой важный механизм, обеспечивающий генетическое разнообразие белков. У Drosophila melanogaster были обнаружены уникальные локусы, где разнообразие мРНК возникает в результате транс-сплайсинга - процесса, при котором экзоны из различных пре-мРНК соединяются. Наиболее подробно исследован транс-сплайсинг в локусе mod(mdg4), который кодирует более 31 изоформы. Важными элементами для этого процесса являются ранее описанные консервативные последовательности в четвертом интроне. Целью данного исследования является дальнейшая характеристика консервативных мотивов четвертого интрона, а именно элемента на 5'-конце интрона. С помощью модельных трансгенных линий показано, что внесенные замены в последовательность изучаемого элемента приводят к нарушению транс-сплайсинга. Напротив, аналогичные изменения в эндогенном локусе не привели к нарушению транс-сплайсинга. Таким образом, консервативный элемент играет роль в транс-сплайсинге, но не является ключевым.

36 0

IDENTIFICATION OF A HIGHLY CONSERVED REGION CRITICAL FOR THE FUNCTIONALITY OF THE CP190 PROTEIN IN DROSOPHILA MELANOGASTER

Issue number 1 from 15.04.2025

Белок СP190 связывается как с промоторами генов домашнего хозяйства, так и с инсуляторными/ граничными элементами и играет критическую роль в их активности. Целью работы являлось изучение влияния делеций в высоко консервативных районах белка CP190 на его функциональность. Показано, что делеция последовательности от 664 до 700 а.о. приводит к летальному фенотипу. Таким образом, в составе СР190 выявлен новый район, играющий важную роль во взаимодействии белка СР190 с еще не идентифицированными белками-партнерами, стабилизации формируемых СP190 белковых комплексов и рекрутировании их на хроматин.

39 0

THE BXD PRE FROM BITHORAX COMPLEX OF DROSOPHILA MELANOGASTER HAS WEAK INSULATOR ACTIVITY

Issue number 1 from 15.04.2025

Автономное функционирование регуляторных доменов в комплексе Bithorax (BX-C) Drosophila mela-nogaster обеспечивается границами (инсуляторами), которые предотвращают взаимодействия между энхансерами и промоторами. Сайленсеры (Polycomb response elements) поддерживают эпигенетическую память в пределах регуляторных доменов и часто расположены рядом с инсуляторами, усиливая их инсуляторную активность. bxd PRE - это хорошо известный сайленсер, который регулирует активность домена bxd/pbx гена Ubx (один из генов BX-C) в первом абдоминальном сегменте. Для исследования инсуляторной активности bxd PRE мы применили стратегию замены границы. В результате было показано, что при интеграции на место границы Fab-7, разделяющей регуляторные домены гена Abd-B в локусе BX-C, bxd PRE обладает слабой инсуляторной активностью.

43 0

An investigation of the conservatism of sequences defining trans-splicing in the <I>mod</I>(<I>mdg4</I>) locus across Drosophila and silkworm species

Issue number 1 from 15.01.2025

Сплайсинг, являясь ключевым этапом созревания мРНК, играет важную роль в регуляции экспрессии генов эукариот. Образование химерных мРНК из двух транскриптов при сплайсинге является запрещенным процессом, однако у насекомых для нескольких локусов транс-сплайсинг является основным способом увеличения белкового разнообразия. Целью работы является исследование эволюционной консервативности последовательностей, ответственных за транс-сплайсинг в локусе mod(mdg4), у видов из семейства Drosophilidae отряда двукрылые и шелкопряда (Bombyx mori), который относится к отряду чешуикрылых. С помощью модельных трансгенных линий показано, что последовательности удаленных видов дрозофилы сохраняют способность поддерживать транс-сплайсинг у D. melanogaster. Напротив, аналогичные последовательности шелкопряда не поддерживают транс-сплайсинг. Таким образом, РНК-мотивы и связывающие их гипотетические белковые факторы, определяющие транс-сплайсинг, остаются консервативными среди группы Drosophilidae, но функционально разошлись у двукрылых и чешуекрылых.

41 0