Статьи автора

ДВА РНК-СВЯЗЫВАЮЩИХ РАЙОНА PCID2, СУБЪЕДИНИЦЫ КОМПЛЕКСА ЯДЕРНОГО ЭКСПОРТА мРНК TREX-2, КОНКУРЕНТНО ВЗАИМОДЕЙСТВУЮТ С3'-НЕКОДИРУЮЩЕЙ ОБЛАСТЬЮ мРНК ras2

Номер выпуска 1 от 15.06.2025

Белок PCID2 является субъединицей комплекса эукариот TREX-2, отвечающего за ядерный экспорт мРНК. В составе комплекса D. melanogaster PCID2 играет важную роль, отвечая за узнавание и связывание молекулы мРНК. PCID2 взаимодействует с участком мРНК ras2 (fr4_2) и имеет два участка связывания, расположенные в его PCI-домене: район М-PCID2, неспецифично связывающий мРНК и C-концевую часть (C-PCID2), специфично узнающую последовательность мРНК ras2 fr4_2. При этом для специфичного связывания с C-PCID2 необходимо предварительное неспецифичное взаимодействие с М-PCID2. Остается неясным, как происходит переход от первичного неспецифичного взаимодействия к специфичному. Взаимодействуют ли оба района с РНК одновременно, или неспецифичное взаимодействие необходимо только на первом этапе для последующего специфичного связывания. В данной работе показано, что связывание M-PCID2 и C-PCID2 с РНК ras2 fr4_2 происходит конкурентно. При этом M-PCID2 связывается более эффективно и вытесняет C-PCID2 из комплекса с фрагментом мРНК ras2. Таким образом, для замены контакта M-PCID2 на C-PCID2 в ходе взаимодействия полноразмерного белка PCID2 с РНК ras2 необходимы дополнительные факторы. Также показано, что точечные мутации в M-PCID2, разрушающие взаимодействие полноразмерного PCID2 с РНК, приводят к большей ассоциации M-PCID2 с РНК. Вероятно, повышение сродства M-PCID2 к РНК нарушает возможность замены M-PCID2 на C-PCID2 в составе полноразмерного PCID2.

31 0

Междоменные взаимодействия белка PCID2, одной из субъединиц комплекса экспорта мРНК TREX‑2 у Drosophila melanogaster

Номер выпуска 1 от 15.06.2025

Комплекс TREX-2 отвечает за экспорт мРНК из ядра в цитоплазму и состоит из четырех белков. Недавно было показано, что за специфичное распознавание мРНК комплексом TREX-2 отвечает его субъединица PCID2. Большую часть белка составляет PCI-домен, который имеет поверхности для связывания РНК. PCI-домен включает центральную область белка, в которой располагается поверхность для неспецифичного связывания РНК, M-PCID2, и C-концевую часть PCI-домена и С-конца белка, C-PCID2, в которой расположена поверхность для специфичного распознавания РНК. В N-концевой части PCID2 находится район, функции которого не известны. Поскольку комплекс TREX-2 связывает только определенную мРНК и только на определенном этапе, мы предположили, что N-концевая часть PCID2 может модулировать связывание C-PCID2 с РНК, связываясь с ним и закрывая его домен связывания с РНК. Мы показали, что N-концевой район взаимодействует с C-PCID2. Связывание C-PCID2 РНК при этом не нарушается. Также связывание C-PCID2 с РНК не нарушает его взаимодействие с N-концевой частью белка (N-PCID2). Таким образом, C-PCID2 может взаимодействовать с N-PCID2 и РНК различными поверхностями. Данное внутрибелковое взаимодействие, вероятно, необходимо на одном из этапов работы комплекса TREX-2.

28 0